医院作为一个病原体相对集中的特殊场所，做好灭菌和消毒工作是重中之重。但目前医院中常用的消毒剂存在杀菌效率低、使用浓度高、对人体有毒性、对器械有腐蚀等诸多缺点。
次氯酸发生器通过电解低浓度盐酸和（或）氯化钠生产出高浓度、高稳定性的次氯酸溶液，能快速有效的杀灭细菌、病毒、真菌、支原体、衣原体和抵抗力极强的细菌芽孢等，不产生耐药性；溶液杀菌后自然降解，对器械无腐蚀，对皮肤黏膜无伤害，对生态环境无污染。可用于医院用水消毒、牙椅水路消毒、医疗器械消毒、皮肤黏膜消毒、床位及病房环境消毒等。
1、空气消毒
在医院病房、走廊、入口中直接喷洒雾化次氯酸水进行空气消毒，由于次氯酸的无害性，不妨碍室内人员的正常活动。
由于次氯酸水可以除臭，因此除了可以有效消毒外，还可以清新医院空气。
另外可以设置自动喷淋装置定期空气消毒，不需要人员回避。
空气消毒
2、伤口护理
（1）作为伤口创面的预防感染消毒剂，已于1994年获得了世界卫生组织的承认。并且在卢旺达维和行动中得到了应用。
伤口护理（产后、烧伤等），通过3例典型病例以及其他病例的临床验证得出结论，利用微酸性次氯酸水治疗严重创面感染是一种极佳的临床严重创面感染的治疗手段,价廉、质佳,取材方便，效果可靠。
（2）内蒙古自治区呼和浩特铁路局中心医院，通过对350例阴道分娩并有会阴伤口病人的观察，结果表明对会阴伤口消毒在未使用微酸性次氯酸水前，其感染率为8.6%。采用次氯酸水冲洗后无一感染，伤口愈合时间明显缩短，病人无任何不适感觉。
伤口护理
3、器械消毒
经过多年的研究、实践，人们对次氯酸杀菌的有效性、安全性、不留残毒、有利于环保等优点得到共识，并在医疗领域用于手消毒、内窥镜的清洗消毒、血液透析装置的消毒、环境的消毒以及褥疮等剖面的治疗。20世纪90年代末次氯酸水生成机进入中国市场，很快得到中国同行的认可，在一些医院用于内窥镜、牙钻、手术室、供应室医疗器械的消毒，获得了理想的效果。
器械消毒
4、物品擦拭消毒
物品擦拭消毒
5、手部消毒
手部消毒
6、病床消毒
病床消毒
7、污水（医废）处理
医疗污水主要是从医院的诊疗室、化验室、病房、洗衣房、X片照相室和手术室等排放的污水，其污水来源及成分十分复杂。医院污水中含有大量的病原细菌、病毒和化学药剂，具有空间污染、急性传染和潜伏性传染的特征。目前国内外基本都在使用含氯消毒制剂进行处理。
使用次氯酸钠发生器可有效消除医废中的有害病菌。
