政府非税收入是政府财政收入的重要组成部分。非税收入的审计应从收缴和支出两方面入手，收入和支出是密不可分的，既可以从收入看支出的使用分配，也可以从支出效益来分析收入分配的合理性。但在审计时发现很多单位还存在对非税收入征收范围、管理方式、收缴制度等方面认识不到位，执行不严的情况，导致政府非税收入应收未收、应缴未缴、坐收坐支、国有资产资源流失等问题的发生。作为审计人员应把握以下重点环节和内容。
一、审查摸清总体情况。审计人员在根据财政部门提供的数据了解地方非税收入规模和结构（预算内、基金、预算外），分部门分项目列出非税收入重点部门和收费项目的排序，根据政府收支分类科目分析非税收入是否存在应缴国库却未缴库的情况，从总体管理上，对非税收入进行摸底排查。
二、审查非税收入征收标准是否符合相关规定。审计人员在确定非税收入科目后，应检查执收单位收费标准是否严格按照政府非税收入相关规定执行，有无擅自提高或降低标准进行征收的情况。同时也要对其开出的票据进行抽查，查看收据联和财务记账联征收金额是否一致，防止大头小尾、少缴非税收入情况的发生。
三、审查非税收入的收费范围、收费对象。审计人员在根据被审单位开出的收费票据，依据其《许可证》核对其收费范围、收费对象，看有无擅自提高标准的问题。查阅“国务院关于第×批取消和调整行政审批项目的决定”，看有无已经取消的行政收费项目仍在收费的情况。
四、审查非税收入是否执行“收支两条线”管理。在日常审计工作中，审计人员发现部份非税收入执收单位按照“谁收、谁管、谁用”的传统做法，认为非税收入缴库后也要纳入本单位预算管理使用，只要没有贪污挪用，缴不缴库都无所谓，导致非税收入未严格实行“收支两条线”管理。为防止非税收入被坐支、挪用等情况，审计人员应认真检查核实会计报表以及非税收入缴款凭证等资料，确保非税收入及时足额上缴国库。
五、审查非税收入是否做到应收尽收。审计人员应将被审计单位业务股室提供的项目征收台账与财务实际征收的非税收入报表进行认真核对，编制非税收入核对情况表，核实是否存在应收未收的非税收入。
政府应加强对非税收入的审计，规范和加强非税收入管理，把非税收入置于财政管理范畴之内，能够筹集相当规模的财政资金，支持地方经济建设，维护人民的根本利益。通过规范政府收费行为，进一步提高政府依法行政、依法理财的水平，从而增强政府宏观调控能力。同时，可以从根本上抑制乱收滥支，切实减轻企业和人民负担，从源头上防治非税收入管理中的不正之风，从而为地方经济发展创造一个良好的投资环境和政策环境。
